W 1997 roku ukończyła z wyróżnieniem Wydział Stomatologii Akademii Medycznej w Poznaniu. Jest specjalistą stomatologii ogólnej, aktywnym członkiem Polskiej Akademii Stomatologii Estetycznej PASE oraz członkiem Polskiego Towarzystwa Endodontycznego. Ukończyła również roczny cykl szkoleń Curriculum Implantologicznego PSI. Jako pierwszy lekarz stomatolog z Polski, w roku 2013 zdała egzamin i otrzymała dyplom podsumowujący trzyletnie, zaawansowane szkolenie protetyczne w Vienna School of Interdisciplinary Dentistry (VieSID) – „Therapy and Treatment Concepts”. W tym samym roku, również w Wiedniu ukończyła roczny cykl szkoleń z zakresu techniki dentystycznej - Curriculum "Gnathology and Occlusion in Interdisciplinary Dentistry With Focus on Dental Laboratory”. W 2017r ukończyła 4 letnie, zaawansowane szkolenie ortodontyczne pod okiem prof. Sadao Sato. "Orthodontics in Craniofacial Dysfunctions"
Agnieszka Szygenda od czternastu lat prowadzi w Poznaniu specjalistyczne centrum Orident, gdzie wraz ze swoim zespołem leczy pacjentów z zaawansowanymi objawami choroby okluzyjnej.
W 2016 roku otrzymała od prof. Rudolfa Slavicka nominację na stanowisko wykładowcy szkoły VieSID oraz propozycję poprowadzenia polskiej edycji VieSID Curriculum „Gnatologia i okluzja w interdyscyplinarnej stomatologii”. Do dziś bazowe szkolenie ukończyło 9 grup lekarzy z całej Polski. W styczniu 2018 roku Agnieszka Szygenda poprowadziła pierwszą edycją dwuletniego zaawansowanego szkolenia z protetyki – VieSID Continuum „Rehabilitacja funkcji i estetyki”. Aktualnie trwa druga edycja tego szkolenia.